Protein–RNA interactions for Protein: Q15006

EMC2, ER membrane protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC2Q15006 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EMC2Q15006 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms