Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms