Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME4Q14997 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms