Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB39AQ14964 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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RAB39AQ14964 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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RAB39AQ14964 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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RAB39AQ14964 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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RAB39AQ14964 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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RAB39AQ14964 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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RAB39AQ14964 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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RAB39AQ14964 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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RAB39AQ14964 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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RAB39AQ14964 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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RAB39AQ14964 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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RAB39AQ14964 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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RAB39AQ14964 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB39AQ14964 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
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