Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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SPIDRQ14159 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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SPIDRQ14159 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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SPIDRQ14159 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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SPIDRQ14159 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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SPIDRQ14159 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPIDRQ14159 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
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