Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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EFR3AQ14156 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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EFR3AQ14156 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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EFR3AQ14156 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFR3AQ14156 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms