Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CBFBQ13951 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBFBQ13951 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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