Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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EXOSC2Q13868 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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EXOSC2Q13868 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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EXOSC2Q13868 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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