Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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