Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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ATP1A4Q13733 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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ATP1A4Q13733 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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ATP1A4Q13733 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
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