Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA7Q13683 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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