Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CUL3Q13618 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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