Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms