Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms