Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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GRIK3Q13003 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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GRIK3Q13003 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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GRIK3Q13003 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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GRIK3Q13003 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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GRIK3Q13003 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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GRIK3Q13003 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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GRIK3Q13003 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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GRIK3Q13003 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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