Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PTP4A2Q12974 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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