Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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