Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TROQ12816 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TROQ12816 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROQ12816 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROQ12816 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROQ12816 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROQ12816 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROQ12816 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROQ12816 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROQ12816 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROQ12816 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROQ12816 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROQ12816 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROQ12816 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROQ12816 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROQ12816 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROQ12816 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROQ12816 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROQ12816 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TROQ12816 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TROQ12816 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
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