Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC173Q0VFZ6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms