Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM1Q08AH1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms