Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms