Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD300CQ08708 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD300CQ08708 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD300CQ08708 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms