Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms