Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM3Q08188 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms