Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms