Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms