Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms