Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARID5AQ03989 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARID5AQ03989 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms