Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2BQ02880 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms