Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 WBP1LP6-201ENST00000438434 424 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AL162390.1-201ENST00000622201 1246 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms