Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OC90Q02509 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OC90Q02509 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OC90Q02509 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OC90Q02509 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OC90Q02509 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OC90Q02509 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OC90Q02509 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OC90Q02509 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OC90Q02509 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OC90Q02509 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms