Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms