Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTCQ00610 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms