Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms