Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms