Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2BP67870 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2BP67870 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms