Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG2P63267 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG2P63267 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG2P63267 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTG2P63267 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTG2P63267 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTG2P63267 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTG2P63267 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTG2P63267 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTG2P63267 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms