Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTA2P62736 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms