Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms