Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms