Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUCLG1P53597 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms