Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPZA1P52907 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPZA1P52907 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms