Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX2P50458 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX2P50458 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms