Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP4P49662 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP4P49662 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP4P49662 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP4P49662 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP4P49662 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP4P49662 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP4P49662 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP4P49662 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP4P49662 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP4P49662 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms