Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTAP49354 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms