Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACADSBP45954 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms