Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP214P35658 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP214P35658 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP214P35658 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms