Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms