Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms