Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms